دوازدهمین کنگره سازمان فدائیان خلق ایران (اکثریت) در روزهای ۲ تا ۵ اردیبهشت ۱۳۹۰ (۲۲ تا ۲۵ آوریل ۲۰۱۱) با شرکت اعضای سازمان و حضور نمایندگان تعدادی از احزاب و سازمانهای سیاسی اپوزیسیون و میهمانان دعوت شده در شهر کلن آلمان برگزار گردید. کنگره توسط هیئت رئیسه سنی افتتاح و با تائید اعتبارنامه اعضای شرکتکننده و انتخاب هیئت رئیسه، کار خود را آغاز کرد. کنگره بعد از رسمیت یافتن به بررسی گزارش ارگانهای منتخب کنگره یازدهم و کمیسیون منتخب شورای مرکزی برای تدوین اسناد پایهای پرداخت. بعد از پاسخ دادن مسئولین به سئوالات مطروحه، اعضای کنگره در مورد عملکرد ارگانها به اظهارنظر پرداختند. بدنبال آن بررسی چهار سند زیر در دستور کار کنگره قرار گرفت: ۱. “سیما، ارزشها و نگاه سازمان” ۲. تدقیق و تکمیل “اساسنامه سازمان” ۳. “راستاهای سیاستهای سازمان در دوره آتی” ۴. “وظائف و اولویتهای سازمان در دوره آتی” کنگره در روز اول بعد از بررسی اولیه اسناد دریافتی و تعیین سند مبنا، چهار کمیسیون تشکیل داد تا اسناد و پیشنهادهای نمایندگان کنگره را مورد رسیدگی قرار دهند. اسناد ارائه شده از جانب کمیسیونها در روزهای بعد به بحث و بررسی کنگره گذاشته شد. اساسنامه، سیاستها و وظائف سازمان در دوره آتی به تصویب کنگره رسید و سند “سیما، ارزشها و نگاه سازمان” رای تمایل کنگره را اخذ کرد. موضوع وحدت سه سازمان در دستور کنگره قرار داشت. در این زمینه دو قرار در اختیار کنگره قرار گرفته بود که قرار شورای مرکزی بعد از بحث و گفتگو به تصویب رسید. در طی چهار روز، آئیننامه کنگره و قرارهای ارائه شده نیز مورد رسیدگی قرار گرفت و در مورد هر یک از آنها تصمیمات مقتضی اتخاذ گردید. کنگره در روز چهارم اعضای شورای مرکزی، کمیسیون رشد و کمیسیون تدارک کنگره آتی را انتخاب کرد. حجم کار کنگره دوازدهم سنگین بود ولی کنگره موفق شد به تمام موضوعات در دستور کار خود بپردازد و سازمان را به اسناد پایه ای مجهز نماید و وظائف و راستاهای سیاست سازمان در دوره آتی را مشخص کند. گزارش تفصیلی کنگره، اسناد، قرارها و پیامها در روزهای آتی منتشر خواهد شد. دبیرخانه شورای مرکزی سازمان فدائیان خلق ایران (اکثریت) ۹ اردیبهشت ۱۳۹۰ (۲۹ آوریل ۲۰۱۱)